L'histoire d'une mère et de sa fille et de leur vie à bord d'un bateau dans un village de pêcheurs.
Japon, 1964. Umi est une jeune lycéenne studieuse qui a perdu son père durant la guerre de Corée. Un jour, elle fait la rencontre de Shun, l'auteur de plusieurs poèmes faisant référence aux pavillons qu'Umi dresse tous les jours en souvenir de son père.
Anna, douze ans, souffre d'asthme. Elle est envoyée pour l'été à la campagne. En explorant les environs, elle découvre une maison abandonnée au milieu d'un marais, et dans cette maison, Marnie, une étrange jeune fille...
Un journaliste interviewe une ancienne actrice qui vit recluse depuis longtemps. Elle se remémore son parcours et sa rencontre avec un étrange jeune homme.
Mary vient d’emménager chez sa grand-tante. Dans la forêt voisine, elle découvre une fleur mystérieuse. On l'appelle la "fleur de la sorcière". Grâce à la fleur, Mary possède des pouvoirs magiques qui lui ouvrent les portes d'Endor, une école de magie.