Après la disparition de sa mère dans un incendie, Mahito, un jeune garçon de 11 ans, doit quitter Tokyo pour partir vivre à la campagne dans le village où elle a grandi.
La vie de Kun est bouleversée par l'arrivée de sa petite sœur, Miraï. Jaloux de ce bébé qui monopolise l'attention de ses parents, le petit garçon se réfugie souvent au fond du jardin. Là, il découvre un monde fantastique dans lequel il peut voyager et rencontrer ses proches à différents âges de leurs vies. À travers ces aventures, Kun découvre sa propre histoire...